"A escola foi atingida durante o bombardeio das forças israelenses", na Faixa de Gaza, indicou, por meio de nota, a UNRWA, sigla em inglês da entidade.
Segundo a agência, dezenas de pessoas também ficaram feridas e o número de mortos é "certamente maior".
Questionado pela AFP, o Exército israelense disse que estava verificando esta informação.
O ocorrido "é escandaloso e mostra mais uma vez o flagrante desprezo pela vida dos civis", condenou a UNRWA, que administra escolas, clínicas e fornece ajuda alimentícia a Gaza.
Segundo a agência da ONU, "pelo menos 4.000 pessoas haviam se abrigado nesta escola da UNRWA, que se tornou um refúgio" devido à guerra entre Hamas, no poder em Gaza, e Israel.
O conflito se seguiu a um sangrento ataque de comandos do movimento islamita em solo israelense em 7 de outubro, que deixou milhares de mortos.
"Não há mais lugar seguro em Gaza, nem sequer as infraestruturas da ONU", lamentou a UNRWA.
Aproximadamente, 5,9 milhões de refugiados palestinos estão registrados na agência, criada em 1949.
FRANJA DE GAZA